Adicionalmente, tuvo la oportunidad de asistir como fellow observacional en el Nickalaus Children Hospital en la ciudad de Miami. El Doctor Marín también ha participado en múltiples congresos nacionales e internacionales dentro del área de Urología pediátrica en donde se ha desempeñado como asistente y conferencista.

Es miembro activo de la Sociedad Colombiana de Urología , de la Sociedad Iberoamericana de urología Pediátrica y de la Sociedad Europea de Urología.

Actualmente el Doctor Emilio Jose Marin Niño, es el jefe y lidera el servicio de Urología Pediátrica de la clínica materno infantil San Luis. Adicionalmente, ejerce su practica en la subespecialidad de Urología Pediátrica en su consultorio (Unidad Medica San Luis) donde esta adscrito a múltiples entidades prestadoras de salud y polizas.